非典属于中医春温、湿热疫病的范畴，病机以湿热蕴毒，阻遏中上二焦，并易耗气挟瘀，甚则内闭喘脱为特点。
治疗方案在分期、分证基础上进行个体化辨证施治。具体分为早期、中期、极期（高峰期）、恢复期四期。
一、早期多在发病后1～5天左右，病机以湿热遏阻，卫气同病为特点。治疗上强调宣透清化。常见证型有湿遏肺卫，表寒里热挟湿二型。
1.湿热遏阻肺卫：症见发热，微恶寒，身重疼痛，乏力，口干饮水不多，或伴有胸闷脘痞，无汗或汗出不畅，或见呕恶纳呆，大便溏泄，舌淡红，苔薄白腻，脉浮略数。
治则：宣化湿热，透邪外达。
方药：三仁汤合升降散加减，湿重热不明显，亦可选用藿朴夏苓汤加减化裁。
2.表寒里热挟湿：症见发热明显，恶寒，甚则寒战壮热，伴有头痛，关节痛，咽干或咽痛，口干饮水不多，干咳少痰，舌偏红，苔薄黄微腻，脉浮数。
治则：辛凉解表，宣肺化湿。
方药：麻杏石甘汤合升降散加减。
二、中期多在发病后3～10天左右，病机以湿热蕴毒，邪伏膜原，邪阻少阳为特点，治疗上强调清化湿热，宣畅气机。
1.湿热蕴毒：症见发热，午后尤甚，汗出不畅，胸闷脘痞，口干饮水不多，干咳或呛咳，或伴有咽痛，口苦或口中粘腻，苔黄腻，脉滑数。
治则：清热化湿解毒。
方药：甘露消毒丹加减。
2.邪伏膜原：症见发热，恶寒，或有寒热往来，伴有身痛，呕逆，口干苦，纳差，或伴呛咳，气促，舌苔白浊腻或如积粉，脉弦滑数。
治则：疏达透达膜原湿浊。
方药：达原饮加减。
3.邪阻少阳：症见发热，呛咳，痰粘不出，汗出，胸闷，心烦，口干口苦不欲饮，呕恶，纳呆便溏，疲乏倦怠，舌苔白微黄或黄腻，脉滑数。
治则：清泄少阳，分消湿热。
方药：蒿芩清胆汤加减。
三、极期（高峰期）多在发病后7～14天左右，临床突出表现为气促喘憋明显，或伴有紫绀，病机以湿热毒盛，耗气伤阴，瘀血内阻为主要特点，少数可表现为邪入营血，气竭喘脱。治疗上在祛邪的同时必须重视扶正，可选用白虎加人参汤、清营汤、犀角汤等加用活血化瘀之品，并静脉使用参附针、参麦针、丹参针等。
1.热入营分，耗气伤阴：症见身热夜甚，喘促烦躁，甚则不能活动，呛咳或有咯血，口干，气短乏力，汗出，舌红绛，苔薄，脉细数。
治则：清营解毒，益气养阴。
方药：清营汤合生脉散加减。
2.邪盛正虚，内闭外脱：症见发热不明显，喘促明显，倦卧于床，不能活动，不能言语，脉细浅数，无力，面色紫绀，或汗出如雨，四肢厥逆，脉微欲绝。
治则：益气固脱或兼以辛凉开窍。
方药：大剂量静点参麦针或参附针，并用参附汤或生脉散（汤）送服安宫牛黄丸或紫雪散。
四、恢复期多在发病后10～14天以后，病机以正虚邪恋，易挟湿挟瘀为主要特点，主要证候有气阴两伤，气虚挟湿挟瘀。治疗强调扶正透邪，并重视化湿活血。
1.气阴两伤：症见热退，心烦，口干，汗出，乏力，气短，纳差，舌淡红，质嫩，苔少或苔薄少津，脉细或细略数。
治则：益气养阴。
方药：参麦散或沙参麦冬汤加减化裁。
2.气虚挟湿挟瘀：症见气短，疲乏，活动后略有气促，纳差，舌淡略暗，苔薄腻，脉细。
治则：益气化湿，活血通络。
方药：据虚实不同可分别选用李氏清暑益气汤，参苓白术散或血府逐瘀汤等加减化裁。
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